Threema chiếm một phân khúc riêng biệt trong bối cảnh nhắn tin được mã hóa: phục vụ những người dùng muốn có cả mật mã học mạnh mẽ lẫn sự ẩn danh thực sự, chứ không chỉ một trong hai. Hầu hết các ứng dụng tập trung vào quyền riêng tư vẫn thu thập số điện thoại trong quá trình đăng ký, điều này gắn tài khoản với danh tính ngoài đời thực. Threema hoàn toàn né tránh điều này bằng cách gán cho mỗi người dùng một Threema ID được tạo ngẫu nhiên. Lựa chọn thiết kế này là tính năng đặc trưng nhất của ứng dụng và có giá trị thực tiễn rõ ràng đối với người dùng trong môi trường rủi ro cao hoặc những người đơn giản là thích sự phân tách danh tính.
Về mặt bảo mật, Threema sử dụng thư viện mật mã học NaCl được đánh giá cao cho mã hóa end-to-end. Tin nhắn, cuộc gọi thoại, trò chuyện nhóm, truyền tệp và thậm chí cả tin nhắn trạng thái đều được mã hóa trước khi rời khỏi thiết bị. Công ty công bố mã nguồn và đã ủy thác kiểm tra độc lập, đây là bước đi có ý nghĩa hướng tới trách nhiệm giải trình. Các tuyên bố về mật mã học có thể được xác minh thay vì chỉ được khẳng định đơn thuần.
Thẩm quyền pháp lý của Thụy Sĩ đáng được lưu ý. Thụy Sĩ không phải là thành viên của EU hay liên minh tình báo Five Eyes, và khung pháp lý của nước này thường đòi hỏi ngưỡng cao hơn cho việc tiết lộ dữ liệu so với nhiều quốc gia khác. Tuy nhiên, Thụy Sĩ không phải là vùng pháp lý trống, và các cuộc điều tra hình sự nghiêm trọng vẫn có thể buộc các công ty Thụy Sĩ hợp tác. Người dùng không nên coi việc lưu trữ tại Thụy Sĩ là sự đảm bảo tuyệt đối về quyền riêng tư.
Về khả năng sử dụng, Threema hoạt động đáng tin cậy. Giao diện gọn gàng mà không bị thiếu các tính năng hữu ích. Trò chuyện nhóm, bình chọn, cuộc gọi thoại và video, tin nhắn tự xóa và chia sẻ tệp đều hoạt động như mong đợi. Ứng dụng máy tính để bàn và giao diện web hoạt động ổn định, mặc dù đồng bộ hóa đa thiết bị trước đây là điểm yếu so với các ứng dụng như Signal, vốn đã giới thiệu hỗ trợ thiết bị liên kết liền mạch sớm hơn. Threema đã cải thiện vấn đề này, nhưng trải nghiệm vẫn chưa mượt mà như một số đối thủ cạnh tranh.
Mô hình định giá vừa là yếu tố khác biệt thực sự vừa là rào cản thực sự. Trả khoảng 5 USD một lần thay vì đăng ký hàng tháng là hợp lý về lâu dài. Tuy nhiên, chi phí trả trước cản trở việc áp dụng tùy tiện. Hiệu ứng mạng lưới rất quan trọng trong nhắn tin, và cơ sở người dùng của Threema vẫn còn nhỏ so với các lựa chọn thay thế phổ biến. Người dùng chuyển sang Threema có thể thấy rằng ít liên hệ hiện có của họ đang ở đó, điều này buộc phải đưa ra lựa chọn khó chịu là duy trì nhiều ứng dụng nhắn tin.
Threema Work, biến thể dành cho doanh nghiệp, mở rộng nền tảng cho các tổ chức sẵn sàng trả giá theo đầu người, mức giá này cạnh tranh trong thị trường truyền thông doanh nghiệp và đã được một số môi trường chính phủ và doanh nghiệp châu Âu áp dụng.