Threema menempati ceruk khusus dalam lanskap pesan terenkripsi: melayani pengguna yang menginginkan kriptografi yang kuat sekaligus anonimitas yang sesungguhnya, bukan hanya yang pertama saja. Sebagian besar aplikasi yang berfokus pada privasi masih mengumpulkan nomor telepon saat pendaftaran, yang menghubungkan akun dengan identitas dunia nyata. Threema menghindari hal ini sepenuhnya dengan memberikan setiap pengguna sebuah Threema ID yang dibuat secara acak. Pilihan desain ini merupakan fitur paling khas dari aplikasi ini dan memiliki nilai praktis yang jelas bagi pengguna di lingkungan berisiko tinggi atau mereka yang sekadar lebih menyukai pemisahan identitas.
Dari sisi keamanan, Threema menggunakan library kriptografi NaCl yang sudah teruji untuk enkripsi end-to-end. Pesan, panggilan suara, obrolan grup, transfer file, bahkan pesan status sekalipun dienkripsi sebelum meninggalkan perangkat. Perusahaan mempublikasikan kode sumbernya dan telah menugaskan audit independen, yang merupakan langkah berarti menuju akuntabilitas. Klaim kriptografi dapat diverifikasi, bukan hanya sekadar pernyataan.
Yurisdiksi Swiss layak untuk dicatat. Swiss bukan bagian dari EU atau aliansi intelijen Five Eyes, dan kerangka hukumnya umumnya mensyaratkan ambang batas yang lebih tinggi untuk pengungkapan data dibandingkan banyak negara lain. Meskipun demikian, Swiss bukan ruang hampa hukum, dan investigasi kriminal serius tetap dapat memaksa kerja sama dari perusahaan-perusahaan Swiss. Pengguna tidak seharusnya menganggap hosting di Swiss sebagai jaminan mutlak atas privasi.
Dari sudut pandang kegunaan, Threema berfungsi dengan andal. Antarmukanya bersih tanpa mengorbankan fitur-fitur yang berguna. Obrolan grup, polling, panggilan suara dan video, pesan yang menghilang otomatis, dan berbagi file semuanya bekerja sesuai harapan. Klien desktop dan antarmuka web berfungsi dengan baik, meski sinkronisasi multi-device secara historis menjadi titik lemah dibandingkan aplikasi seperti Signal, yang memperkenalkan dukungan linked-device yang mulus lebih awal. Threema telah membuat peningkatan di sini, namun pengalamannya belum sehalus beberapa pesaing.
Model penetapan harga ini sekaligus merupakan pembeda yang nyata dan hambatan yang nyata. Membayar sekitar $5 sekali, bukan berlangganan bulanan, tergolong terjangkau dalam jangka panjang. Namun, biaya di muka ini menghalangi adopsi kasual. Efek jaringan sangat krusial dalam aplikasi pesan, dan basis pengguna Threema tetap kecil dibandingkan alternatif arus utama. Pengguna yang beralih ke Threema mungkin menemukan sedikit kontak yang sudah ada di sana, yang memaksa pilihan tidak nyaman untuk mempertahankan beberapa aplikasi pesan sekaligus.
Threema Work, varian enterprise-nya, memperluas platform ke organisasi yang bersedia membayar harga per kursi, yang kompetitif dalam pasar komunikasi bisnis dan telah mendapat adopsi di beberapa lingkungan pemerintah dan perusahaan Eropa.