A Threema az titkosított üzenetküldés területén egy sajátos rést tölt be: olyan felhasználókat szolgál ki, akik erős kriptográfiát és valódi anonimitást egyaránt szeretnének, nem csupán az előbbit. A legtöbb adatvédelemre összpontosító alkalmazás regisztrációkor még mindig bekér egy telefonszámot, amely egy valós személyazonossághoz köti a fiókot. A Threema ezt teljes egészében megkerüli azzal, hogy minden felhasználónak egy véletlenszerűen generált Threema ID-t oszt ki. Ez a tervezési döntés az alkalmazás legemlékezetesebb jellemzője, és egyértelmű gyakorlati értékkel bír a magas kockázatú környezetben tevékenykedő felhasználók, illetve azok számára, akik egyszerűen csak az elkülönítettséget (compartmentalization) részesítik előnyben.
Biztonsági szempontból a Threema a jól bevált NaCl kriptográfiai könyvtárat alkalmazza a végponttól végpontig terjedő titkosításhoz. Az üzenetek, hanghívások, csoportos csevegések, fájlátvitelek, sőt még az állapotüzenetek is titkosítva kerülnek elküldésre az eszközről. A vállalat közzéteszi forráskódját, és független auditokat is megrendelt, ami érdemi lépés az elszámoltathatóság felé. A kriptográfiai állítások így ellenőrizhetők, nem csupán egyoldalúan deklaráltak.
Érdemes megjegyezni a svájci joghatóságot. Svájc nem tagja sem az EU-nak, sem a Five Eyes hírszerzési szövetségnek, és jogi keretrendszere általában magasabb küszöböt szab az adatszolgáltatáshoz, mint sok más ország. Ugyanakkor Svájc sem jogi vákuum, és komoly bűnügyi nyomozások esetén svájci cégek is kényszert tapasztalhatnak az együttműködésre. A felhasználóknak nem szabad a svájci tárhelyet az adatvédelem abszolút garanciájaként kezelni.
Használhatóság szempontjából a Threema megbízhatóan működik. A felület letisztult, de nem szorul meg a hasznos funkcióktól. A csoportos csevegés, szavazások, hang- és videóhívások, eltűnő üzenetek (disappearing messages) és fájlmegosztás mind az elvárásoknak megfelelően működnek. Az asztali kliens és a webes felület funkcionális, bár a több eszközön való szinkronizáció (multi-device synchronization) történetileg gyenge pontnak számított a Signalhoz képest, amely korábban vezette be a zökkenőmentes, összekapcsolt eszközök támogatását. A Threema ezen a téren fejlődött, de a felhasználói élmény még nem olyan gördülékeny, mint egyes versenytársaknál.
Az árazási modell egyszerre valódi megkülönböztető tényező és valódi akadály. Hozzávetőlegesen 5 dollárt egyszer kifizetni a havi előfizetés helyett hosszú távon ésszerű megoldás. Az előzetes költség azonban elveszi a kedvet a próbaképpeni használattól. A hálózati hatások (network effects) kritikusak az üzenetküldésben, és a Threema felhasználói bázisa a mainstream alternatívákhoz képest kicsi marad. Egy Threema-ra váltó felhasználó azt tapasztalhatja, hogy kevés meglévő ismerőse van jelen a platformon, ami arra kényszeríti, hogy több üzenetküldő alkalmazást tartson fenn párhuzamosan.
A Threema Work, a vállalati változat, kiterjeszti a platformot azokra a szervezetekre, amelyek hajlandók egy felhasználónkénti (per-seat) díjat fizetni. Ez az üzleti kommunikációs piacon versenyképes, és egyes európai kormányzati és vállalati környezetekben elfogadásra talált.